Ferenc húsvéthétfőn, 88 éves korában halt meg a Santa Marta házban. Húsvét vasárnap még megadta az Urbi et Orbi áldást. Az utolsó két hónapban számos légzőszervi szövődményben szenvedett. Egyik kívánsága az volt, hogy ne a Szent Péter-bazilikában temessék el.
Kevin Farrel bíboros megerősítette Ferenc pápa halálhírét. A pápa 88 éves korában hunyt el lakhelyén, a Santa Marta házban. Egy nappal korábban, virágvasárnapon még részt vett a Szent Péter-bazilikában tartott szentmisén, ahol megadta az Urbi et Orbi áldást. A pápa az oxigénkanül nélkül jelent meg, amelyet a hónapok óta tartó légzőszervi szövődmények miatt kórházba szállítása óta viselt.
Halála után az egyházban megkezdődnek az előkészületek az új pápa konklávéban történő megválasztására. Ezt megelőzően kerül sor Ferenc temetésére, amelyet történelmileg nagy liturgia övez. A Szentatya pápasága alatt vállalta, hogy leegyszerűsíti az egyházi pompa egy részét, és ez kihat majd a temetésére is.
Ferenc még életében kifejezte azt a szándékát, hogy ne a vatikáni Szent Péter-bazilikában temessék el, mint elődjeit. Alázatossága hirdetésének megfelelően egyértelművé tette szándékát, hogy a római Santa Maria Maggiore bazilikában temessék el, ahol gyakran megfordult.
"Ez az én nagy áhítatom" - ismerte el néhány interjúban e templomra utalva. Nemcsak azt mondta, hogy hol akarja, hogy eltemessék, hanem a pontos helyet is megjelölte. Ferencet kívánsága szerint egy egyszerű kápolnában fogják eltemetni , amelyben eddig a templom bal oldali mellékhajójában, két gyóntatószék mellett kandelábereket tartottak.
Igaz, nem ő az első pápa, akit a Szent Péter templomon kívül temetnek el. Valójában hét másik pápa van eltemetve a Santa Maria Maggiore-ban. Ferenc kötődése azonban különösen erős ehhez a templomhoz, hiszen minden pápai útja előtt ide járt imádkozni.
A Santa Maria Maggiore-bazilika a római Esquilinus-domb tetején található, ahol 16 évszázaddal ezelőtt emelték, és a pápai bazilika címet viseli. Ez egyike annak a négy bazilikának, amelyet ez a megtiszteltetés ért az olasz fővárosban. Itt található a római nép megmentőjének tartott Santa Maria di Maggiore római szobra.
Az egyházi hagyomány szerint ez a szűz jelent meg János pátriárka és Liberius pápa álmában. Ezekben arra kérte őket, hogy építsenek templomot a tiszteletére. A templom felállításának helyét egy nagy, csodálatos hóesés révén tudatta velük , amelynek emlékére minden augusztus 5-én fehér szirmokat szórnak a templom tetejéről.
Bár ezen a helyen fogják eltemetni, a temetésére a Szent Péter téren kerül sor, a bíborosok plenáris ülésén kiválasztandó időpontban. Ferenc kifejezett kívánságára egy egyszerű,"földhöz közeli" rítust követve, a korábbi temetéseken megőrzött ősi középkori hagyományok követése nélkül.
A temetésre a világ minden tájáról érkeznek majd államfők. A 80 év alatti bíborosok az első sorokban foglalnak majd helyet. Rómába különjáratokat várnak szülőhazájából, Argentínából is. Ferenc pápa temetése után kilenc egymást követő napon át tartanak majd miséket, ezalatt a bíborosok kitűzik a konklávé kezdetének időpontját - ez legkésőbb május 11-e lesz - , amelyen döntenek majd az utódjáról.