Svéd kutatók szerint már induláskor sérült lehetett a hajótest.
Korábban ismeretlen, kisebb sérüléseket - esetleg lyukakat - szakíthatott fel egy tengerfenék mélyén lapuló szikla és ezért süllyedhetett el 1994-ben Észtország partjainál az M/S Estonia.
A komp balesete volt Európa legnagyobb tengeri tragédiája békeidőben. A Tallinból Stockholmba közlekedő járat fedélzetén 852-en utaztak, közülük 715-en vesztek a tengerbe.
Az 1997-es nyomozás még arra jutott, hogy a katasztrófát az ajtónyitó berendezések meghibásodása okozta. A hatalmas viharban egyszer csak kinyílt az autókat beengedő rámpa és a hajótest pillanatok alatt megtelt vízzel.
Nemsokkal a hidegháború vége után sok összeesküvés elmélet szárnyra kapott. Ezek szerint a komp egy tengeralattjárónak ütközött vagy valaki direkt felrobbantotta. A kutatók 27 év után ezeket a híreszteléseket próbálták megcáfolni.