Hiába volt eredményes az afrikai ország a riói játékokon, sok panasz érkezett a testületre.
Feloszlatták Kenyában a Nemzeti Olimpiai Bizottságot arra hivatkozva, hogy nem kezelték megfelelően a nemzeti válogatottat a riói olimpiai játékok alatt.
A sportért felelős államtitkár Hassan Wario vizsgálatot rendelt el több ügyben, például hogy kiderüljön, mikét fordulhatott elő, hogy egy edző adott vizeletmintát egy sportoló helyett a doppingteszten.
A problémák ellenére a riói nyári játékok volt Kenya eddigi legsikeresebb olimpiai szereplése, hat aranyérmet nyertek, hat ezüstöt és egy bronzot, mindet atlétikai számokban.
A David Rudisha, Vivian Cheruiyot és Eliud Kipchoge vezette csapat a második legeredményesebb volt atlétikában az Egyesült Államok után.